Program Studi Ilmu Al-Qur'an dan Tafsir merupakan program studi yang memfokuskan diri pada studi mendalam tentang Al-Qur'an, kitab suci umat Islam, serta penafsiran dan pemahaman ayat-ayatnya. Program studi ini bertujuan untuk menghasilkan ahli tafsir yang memiliki kemampuan untuk menafsirkan Al-Qur'an dengan pendekatan ilmiah yang sesuai dengan prinsip-prinsip Islam, serta dapat mengkaji dan menerapkan makna Al-Qur'an dalam konteks zaman modern.
"Menjadi program studi bidang Ilmu al-Quran dan tafsir yang unggul dan berkelas dunia berbasis siber dengan paradigma integratif, aktif dan transformatif pada tahun 2039."
| Bahasa Arab | 3 SKS | W |
| Bahasa Indonesia | 2 SKS | W |
| Filsafat Ilmu | 2 SKS | W |
| Hadits Studies | 2 SKS | W |
| Ilmu Kalam | 2 SKS | W |
| Ilmu Ushul Fiqih | 2 SKS | W |
| Kajian Kitab Kuning 1 | 0 SKS | W |
| Metode Membaca Kitab | 2 SKS | W |
| Metodologi Studi Islam | 3 SKS | W |
| Pancasila | 2 SKS | W |
| Program Pengembangan Tilawatil Qur'an (PPTQ) 1 | 0 SKS | W |
| Qur'an Studies | 2 SKS | W |
| Bahasa Inggris | 3 SKS | W |
| Cirebon Studies | 2 SKS | W |
| Cyber Culture | 2 SKS | W |
| Ilmu Tasawuf dan Psikoterapi | 2 SKS | W |
| Ilmu-ilmu Al-Qur'an Klasik | 2 SKS | W |
| Ilmu-ilmu Hadis | 2 SKS | W |
| Kajian Al-Qur'an berbasis Teknologi Informasi | 2 SKS | W |
| Kajian Kitab Kuning 2 | 0 SKS | W |
| Pemikiran dan Peradaban Islam | 2 SKS | W |
| Pendidikan Kewarganegaraan | 2 SKS | W |
| Program Pengembangan Tilawatil Qur'an (PPTQ) 2 | 0 SKS | W |
| Tahsin dan Hifdz Al-Qur'an | 2 SKS | W |