UIN Siber Syekh Nurjati Cirebon mendapatkan status Akreditasi B dari Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) dengan No. SK: 66/SK/BAN-PT/Ak-PNB/PT/II/2025.
UIN Siber Syekh Nurjati Cirebon mendapatkan sertifikasi SNI ISO 9001:2015 dengan No. Register: 824 100 18114 dalam lingkup Layanan Pendidikan Tinggi untuk Fakullas llmu Tarbiyah dan Keguruan, Fakultas Syariah, Fakultas Ekonomi dan Bisnis lslam, Fakultas Ushuludin dan Adab, Fakultas Dakwah dan Komunikasi lslam, dan Program Pascasarjana termasuk Perancangan Pendidikan, Pengembangan Kurikulum, Proses Perkuliahan dan Penilaian Hasil Belajar.